Aspose.Medical DICOM в текстовий конвертер для бази знань .NET
Як перетворити кілька файлів DICOM в єдиний JSON Array

Як перетворити кілька файлів DICOM в єдиний JSON Array

Цей навчальний заклад показує, як конвертувати кілька файлів DICOM в одну JSON серію з використанням C#.Цей підхід ідеально підходить для інженерів даних, які потребують експортування метадатів DIKOM для аналітичних інструментів, баз даних або трубопроводів даних.

Переваги експорту JSON Array

  • • Використання інформаційних технологій:- Ввезення декількох записів DICOM в бази даних в одній операції.

  • Аналітики готові:- Джерела JSON можна завантажувати безпосередньо в Python, Spark або склади даних.

  • «Комплексний вихід»:- Єдиний файл, що містить всі метадані, полегшує управління даними.

Докладніше: Підготовка навколишнього середовища

  • Налаштування Visual Studio або будь-якого сумісного .NET IDE.
  • Створення нового проекту .NET 8 консолі.
  • Завантажити Aspose.Medical з NuGet Package Manager.
  • Підготувати папку, що містить кілька файлів DICOM.

Крок за кроком Посібник для перетворення декількох файлів DICOM в JSON Array

Крок 1: Інсталяція Aspose.Medical

Додайте бібліотеку Aspose.Medical до вашого проекту за допомогою NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Крок 2: Включити необхідні іменні простори

Додайте посилання на необхідні іменні простори у вашому коді.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

Крок 3: Завантажити кілька файлів DICOM

Завантажити файли DICOM з папки в колекцію.

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
}

Крок 4: Екстракт Dataset Array

Створіть ряд об’єктів Dataset з завантажених файлів.

Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

Крок 5: Серіалізуйте до JSON Array

Користувати DicomJsonSerializer.Serialize У зв’язку з тим, що Dataset Array.

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

Крок 6: Зберегти JSON Array

Зареєструйте JSON Array до файлу.

File.WriteAllText("dicom_studies.json", jsonArray);
Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} DICOM datasets to JSON array.");

Повний код прикладу

Ось повноцінний приклад, який показує, як конвертувати кілька файлів DICOM в JSON:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string outputFile = "dicom_studies.json";

// Get all DICOM files
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
Console.WriteLine($"Found {dicomPaths.Length} DICOM files.");

// Load all files
List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Skipping invalid file: {Path.GetFileName(path)}");
    }
}

// Build dataset array
Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

// Serialize to JSON array
string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

// Save to file
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Successfully exported {datasets.Length} datasets to {outputFile}");

Приклад JSON Array Output

Вихідний JSON Array виглядає таким:

[
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "DOE^JOHN" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["12345"] }
  },
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "SMITH^JANE" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["67890"] }
  }
]

Обробка великих даних за допомогою LINQ

Для кращого управління пам’яттю з великими наборами даних використовуйте проекції LINQ:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\LargeDicomArchive";
string outputFile = "large_export.json";

// Process files lazily to manage memory
Dataset[] datasets = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm")
    .Select(path => 
    {
        try
        {
            return DicomFile.Open(path).Dataset;
        }
        catch
        {
            return null;
        }
    })
    .Where(ds => ds != null)
    .ToArray()!;

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} datasets.");

Додати доповідь про прогрес

Для великих матчів додайте доповідь про прогрес:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<Dataset> datasets = new();
int processed = 0;
int total = dicomPaths.Length;

foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(path);
        datasets.Add(dcm.Dataset);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Error: {Path.GetFileName(path)} - {ex.Message}");
    }
    
    processed++;
    if (processed % 100 == 0 || processed == total)
    {
        Console.WriteLine($"Progress: {processed}/{total} ({processed * 100 / total}%)");
    }
}

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets.ToArray(), writeIndented: true);
File.WriteAllText("export.json", jsonArray);

Console.WriteLine($"Export complete: {datasets.Count} datasets.");

Ввезення JSON Array в інструменти аналізу

Приклад Python 

import json
import pandas as pd

# Load the exported JSON array
with open('dicom_studies.json', 'r') as f:
    dicom_data = json.load(f)

# Convert to DataFrame for analysis
df = pd.json_normalize(dicom_data)
print(df.head())

Завантажити в MongoDB 

// Using mongoimport
// mongoimport --db medical --collection studies --jsonArray --file dicom_studies.json

Пам’ять розглядів

При роботі з великими наборами даних:

  • Процес в батах: Розділити файли на бати 100-500 файлів.
  • Stream Output: Використовуйте серіалізацію на основі потоку для дуже великих смуг.
  • Постачати файли: Переконайтеся, що об’єкти DicomFile розчиняються після вилучення наборів даних.
// Batch processing example
int batchSize = 100;
string[] allFiles = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
int batchNumber = 0;

for (int i = 0; i < allFiles.Length; i += batchSize)
{
    string[] batch = allFiles.Skip(i).Take(batchSize).ToArray();
    Dataset[] datasets = batch
        .Select(path => DicomFile.Open(path).Dataset)
        .ToArray();
    
    string batchJson = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
    File.WriteAllText($"batch_{batchNumber++}.json", batchJson);
}

Додаткова інформація

  • Формат JSON Array ідеально підходить для масових імпорту в NoSQL-бази даних.
  • Розглянемо компресію великих файлів JSON для ефективності зберігання.
  • Для стрімування сценаріїв, розгляньте замість цього використання формату NDJSON (newline-delimited JSON).

Заключення

Цей навчальний заклад показав вам, як конвертувати кілька файлів DICOM в одну JSON серію в C# за допомогою Aspose.Medical.Цей підхід дозволяє ефективний масовий експорт даних для аналізу, імпорту баз даних та інтеграції трубопроводу даних.

 Українська