Ako rozdeliť anonymizáciu priečinka štúdií DICOM
Tento tutoriál ukazuje, ako anonymizovať viaceré súbory DICOM z priečinka pomocou C#. Pri práci s stovkami alebo tisíckami lekárskych obrázkových súborov je spracovanie balíkov nevyhnutné pre účinnosť a konzistenciu.
Výhody batchovej anonymizácie
efektívnosť:- Proces celé štúdie alebo archívy v jednej operácii.
Súdržnosť:- Použite rovnaké pravidlá anonymizácie pre všetky súbory.
Automatizácia:- Integrovať do automatizovaných pracovných tokov a potrubí.
Predpoklady: Príprava životného prostredia
- Nastaviť Visual Studio alebo akýkoľvek kompatibilný .NET IDE.
- Vytvorte nový projekt aplikácie .NET 8 konzoly.
- Inštalovať Aspose.Medical z NuGet Package Manager.
- Pripravte vstupnú priečinok s súbormi DICOM a vytvorte výstupnú dosku.
Krok za krokom sprievodca Batch Anonymizovať DICOM súbory
Krok 1: Inštalácia Aspose.Medical
Pridajte do projektu Aspose.Medicínska knižnica pomocou NuGet.
Install-Package Aspose.MedicalKrok 2: Vložte potrebné názvové priestory
Pridajte odkazy na požadované názvové priestory vo vašom kóde.
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;Krok 3: Nastavenie adresárskych ciest
Definujte svoje vstupné a výstupné priečinky.
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);Krok 4: Zoznam DICOM súborov
Získajte všetky súbory DICOM z vstupného katalógu vrátane subdirektorií.
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
inputDirectory,
"*.dcm",
SearchOption.AllDirectories
);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");Krok 5: Vytvorte anonymizátor
Vytvorte príklad anonymizácie so svojím požadovaným profilom.
Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
// ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);Krok 6: Spracovať každý súbor
Prejdite cez každý súbor, anonymizujte ho a uložte ho do výstupného katalógu.
int successCount = 0;
int failCount = 0;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
try
{
// Load DICOM file
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
// Anonymize
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
// Preserve relative directory structure
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
// Ensure subdirectory exists
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
// Save anonymized file
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
}
}
Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");Kompletný príklad kódu pre anonymizáciu batch
Tu je úplný príklad demonštrovania anonymizácie s hlásením pokroku:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");
// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();
int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
try
{
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
// Progress reporting
double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
}
}
Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");Paralelné spracovanie pre lepšiu výkonnosť
Pri veľkých dátových súboroch použite paralelné spracovanie na využívanie viacerých CPU kórov:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");
// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();
// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
try
{
// Each thread gets its own anonymizer instance
Anonymizer anonymizer = new();
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
{
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
}
anonymizedDcm.Save(outputPath);
Interlocked.Increment(ref successCount);
}
catch (Exception ex)
{
Interlocked.Increment(ref failCount);
failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
}
});
Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
if (failedFiles.Any())
{
Console.WriteLine($"\nFailed files:");
foreach (string failure in failedFiles)
{
Console.WriteLine($" - {failure}");
}
}Vylepšená verzia s logovaním
Pre výrobné prostredie, implementovať správne logovanie:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();
logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");
int successCount = 0;
int failCount = 0;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
try
{
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
}
}
logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");
// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);
Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");Najlepšie postupy na spracovanie batchov
- Run on Copy of Data: Vždy spracováva kópiu vašich pôvodných údajov, nie samotných originálov.
- Log Všetky operácie: Udržujte podrobné záznamy, z ktorých súbory boli spracované a akékoľvek chyby sa vyskytli.
- Test First: Prejdite na malú vzorku pred spracovaním celého databázy.
- Monitor Disk Space: Zabezpečte dostatočný priestor na disk pre výstupné súbory.
- Handle Interruptions: Zvážte implementáciu funkcie checkpoint/resume pre veľmi veľké balíky.
Troubleshooting
Problémy s pamäťou s veľkými databázami
Pri veľmi veľkých súboroch alebo databázach spracúvame súbory raz za čas bez zachovania odkazov:
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
{
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
}
// Files are disposed after each iteration
}Chyby povolenia
Uistite sa, že vaša aplikácia prečítala prístup k vkladovému katalógu a napíšte prístup do výstupného katalógov.
Záver
Tento tutoriál ukázal, ako kombinovať anonymizovať súbory DICOM v C# pomocou Aspose.Medical. Či už spracovanie stoviek alebo tisícov súborov, batch prístup zabezpečuje konzistentnú anonymitu v celom dátovom sústave a zároveň poskytuje sledovanie pokroku a riešenie chýb pre spoľahlivosť výroby.