Ako rozdeliť anonymizáciu priečinka štúdií DICOM

Ako rozdeliť anonymizáciu priečinka štúdií DICOM

Tento tutoriál ukazuje, ako anonymizovať viaceré súbory DICOM z priečinka pomocou C#. Pri práci s stovkami alebo tisíckami lekárskych obrázkových súborov je spracovanie balíkov nevyhnutné pre účinnosť a konzistenciu.

Výhody batchovej anonymizácie

  • efektívnosť:- Proces celé štúdie alebo archívy v jednej operácii.

  • Súdržnosť:- Použite rovnaké pravidlá anonymizácie pre všetky súbory.

  • Automatizácia:- Integrovať do automatizovaných pracovných tokov a potrubí.

Predpoklady: Príprava životného prostredia

  • Nastaviť Visual Studio alebo akýkoľvek kompatibilný .NET IDE.
  • Vytvorte nový projekt aplikácie .NET 8 konzoly.
  • Inštalovať Aspose.Medical z NuGet Package Manager.
  • Pripravte vstupnú priečinok s súbormi DICOM a vytvorte výstupnú dosku.

Krok za krokom sprievodca Batch Anonymizovať DICOM súbory

Krok 1: Inštalácia Aspose.Medical

Pridajte do projektu Aspose.Medicínska knižnica pomocou NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Krok 2: Vložte potrebné názvové priestory

Pridajte odkazy na požadované názvové priestory vo vašom kóde.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Krok 3: Nastavenie adresárskych ciest

Definujte svoje vstupné a výstupné priečinky.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Krok 4: Zoznam DICOM súborov

Získajte všetky súbory DICOM z vstupného katalógu vrátane subdirektorií.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Krok 5: Vytvorte anonymizátor

Vytvorte príklad anonymizácie so svojím požadovaným profilom.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Krok 6: Spracovať každý súbor

Prejdite cez každý súbor, anonymizujte ho a uložte ho do výstupného katalógu.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Kompletný príklad kódu pre anonymizáciu batch

Tu je úplný príklad demonštrovania anonymizácie s hlásením pokroku:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Paralelné spracovanie pre lepšiu výkonnosť

Pri veľkých dátových súboroch použite paralelné spracovanie na využívanie viacerých CPU kórov:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Vylepšená verzia s logovaním

Pre výrobné prostredie, implementovať správne logovanie:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Najlepšie postupy na spracovanie batchov

  • Run on Copy of Data: Vždy spracováva kópiu vašich pôvodných údajov, nie samotných originálov.
  • Log Všetky operácie: Udržujte podrobné záznamy, z ktorých súbory boli spracované a akékoľvek chyby sa vyskytli.
  • Test First: Prejdite na malú vzorku pred spracovaním celého databázy.
  • Monitor Disk Space: Zabezpečte dostatočný priestor na disk pre výstupné súbory.
  • Handle Interruptions: Zvážte implementáciu funkcie checkpoint/resume pre veľmi veľké balíky.

Troubleshooting

Problémy s pamäťou s veľkými databázami

Pri veľmi veľkých súboroch alebo databázach spracúvame súbory raz za čas bez zachovania odkazov:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Chyby povolenia

Uistite sa, že vaša aplikácia prečítala prístup k vkladovému katalógu a napíšte prístup do výstupného katalógov.

Záver

Tento tutoriál ukázal, ako kombinovať anonymizovať súbory DICOM v C# pomocou Aspose.Medical. Či už spracovanie stoviek alebo tisícov súborov, batch prístup zabezpečuje konzistentnú anonymitu v celom dátovom sústave a zároveň poskytuje sledovanie pokroku a riešenie chýb pre spoľahlivosť výroby.

 Slovenčina