Как конвертировать DICOM в XML и назад с помощью DicomXmlSerializer

Как конвертировать DICOM в XML и назад с помощью DicomXmlSerializer

Этот урок показывает, как конвертировать файлы DICOM в XML-формат и десертизировать XML обратно в DicOM с помощью C#. Формат XML предпочтительнее для интеграции с наследственными системами, рабочими потоками HL7 и средами, где XML инструментарий хорошо установлен.

Когда использовать XML через JSON

    • Легальная интеграция *:- Существующие средние программы и системы часто ожидают XML-формата.
  • ** Совместимость HL7*- Системы здравоохранения, использующие HL7 v2/v3, обычно работают с XML.

  • • XML Tooling:- Организации с установленными трансформациями XSLT и запросами XPath.

    • Схема валидации*- Схемы XML обеспечивают строгие возможности валидации.

Преимущества: Подготовка к окружающей среде

  • Настройка Visual Studio или любой совместимый .NET IDE.
  • Создайте новый проект приложения .NET 8 для консоли.
  • Инсталляция Aspose.Medical из NuGet Package Manager.

Шаг за шагом Руководство для конвертации DICOM в XML

Шаг 1: Инсталляция Aspose.Medical

Добавьте в свой проект библиотеку Aspose.Medical с помощью NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Шаг 2: Включение необходимых номенклатур

Добавьте ссылки на требуемые именные пространства в вашем коде.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

Шаг 3: Загрузите файл DICOM

Загрузите файл DICOM, который вы хотите конвертировать.

DicomFile dcm = DicomFile.Open("patient_scan.dcm");

Шаг 4: Сериализировать к XML

Используйте DicomXmlSerializer.Serialize Метод конвертации в XML.

string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dcm.Dataset);

Шаг 5: Сохранение выхода XML

Сохраните XML в файл для хранения или передачи.

File.WriteAllText("patient_scan.xml", xml);

Шаг 6: Deserialize XML Back to Dataset

Чтобы конвертировать XML обратно в DICOM, используйте Deserialize и метода.

Dataset? dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);

Полный пример кода: DICOM в XML Conversion

Вот полный пример конвертации DICOM в XML:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

// Load DICOM file
DicomFile dcm = DicomFile.Open("patient_scan.dcm");

// Convert to XML
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dcm.Dataset);

// Save to file
File.WriteAllText("patient_scan.xml", xml);

Console.WriteLine("DICOM converted to XML successfully!");
Console.WriteLine($"Output saved to: patient_scan.xml");

Полный пример кода: XML в DICOM конверсия

Вот полный пример конвертации XML обратно в DICOM:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

// Read XML from file
string xml = File.ReadAllText("patient_scan.xml");

// Deserialize to Dataset
Dataset? dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);

if (dataset != null)
{
    // Create DicomFile from Dataset
    DicomFile dcm = new DicomFile(dataset);
    
    // Save as DICOM file
    dcm.Save("reconstructed.dcm");
    
    Console.WriteLine("XML converted back to DICOM successfully!");
}
else
{
    Console.WriteLine("Failed to deserialize XML.");
}

Пример: DICOM → XML → DIKOM

Полный круглый маршрут конверсии, демонстрирующий целостность данных:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

// Load original DICOM file
DicomFile original = DicomFile.Open("original_scan.dcm");
Console.WriteLine("Original DICOM loaded.");

// Convert to XML
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(original.Dataset);
Console.WriteLine($"Converted to XML ({xml.Length} characters).");

// Save XML (for transmission or storage)
File.WriteAllText("intermediate.xml", xml);

// Later: Deserialize XML back to Dataset
string loadedXml = File.ReadAllText("intermediate.xml");
Dataset? reconstructedDataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(loadedXml);

if (reconstructedDataset != null)
{
    // Create new DicomFile
    DicomFile reconstructed = new DicomFile(reconstructedDataset);
    reconstructed.Save("reconstructed_scan.dcm");
    
    Console.WriteLine("Round-trip complete: DICOM → XML → DICOM");
}

Пример XML Output Structure

Выход XML представляет теги DICOM в структурированном формате:

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<NativeDicomModel>
  <DicomAttribute tag="00080005" vr="CS" keyword="SpecificCharacterSet">
    <Value number="1">ISO_IR 100</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00080020" vr="DA" keyword="StudyDate">
    <Value number="1">20240115</Value>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00100010" vr="PN" keyword="PatientName">
    <PersonName number="1">
      <Alphabetic>
        <FamilyName>DOE</FamilyName>
        <GivenName>JOHN</GivenName>
      </Alphabetic>
    </PersonName>
  </DicomAttribute>
  <DicomAttribute tag="00100020" vr="LO" keyword="PatientID">
    <Value number="1">12345</Value>
  </DicomAttribute>
</NativeDicomModel>

Сравнение JSON против XML

Размер сравнения

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

DicomFile dcm = DicomFile.Open("sample.dcm");

string json = DicomJsonSerializer.Serialize(dcm);
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dcm.Dataset);

Console.WriteLine($"JSON size: {json.Length:N0} characters");
Console.WriteLine($"XML size: {xml.Length:N0} characters");
// XML is typically 20-40% larger than JSON

Применение случайных рекомендаций

ScenarioРекомендуемый формат
Новые сервисы WEBJSON
Интеграция PACSXML
HL7 среднийXML
JavaScript фронтоныJSON
Трансформация XSLTXML
NoSQL базы данныхJSON
Схема валидацииXML

Интеграция с наследственными системами

Пример интеграции с наследием middleware:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;
using System.Net.Http;
using System.Text;

DicomFile dcm = DicomFile.Open("patient_scan.dcm");
string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dcm.Dataset);

// Send to legacy SOAP service
using HttpClient client = new();
var content = new StringContent(xml, Encoding.UTF8, "application/xml");

HttpResponseMessage response = await client.PostAsync(
    "http://legacy-pacs/dicom/import",
    content
);

if (response.IsSuccessStatusCode)
{
    Console.WriteLine("XML successfully sent to legacy system!");
}

Troubleshooting

Обработка недействительных XML

Загрузить десертификацию в try-catch для обработки ошибок:

try
{
    Dataset? dataset = DicomXmlSerializer.Deserialize(xml);
    if (dataset == null)
    {
        Console.WriteLine("Deserialization returned null.");
    }
}
catch (System.Xml.XmlException ex)
{
    Console.WriteLine($"XML parsing error: {ex.Message}");
}
catch (Exception ex)
{
    Console.WriteLine($"Deserialization error: {ex.Message}");
}

Характер кодирования проблем

Убедитесь в правильном кодировании при чтении / написании XML-файлов:

// Write with explicit encoding
using (StreamWriter writer = new StreamWriter("output.xml", false, Encoding.UTF8))
{
    writer.Write(xml);
}

// Read with explicit encoding
using (StreamReader reader = new StreamReader("input.xml", Encoding.UTF8))
{
    string xml = reader.ReadToEnd();
}

обработка больших файлов

Для очень больших DICOM файлов, рассмотрим потоки:

using (FileStream fs = File.Create("large_output.xml"))
using (StreamWriter writer = new StreamWriter(fs, Encoding.UTF8))
{
    string xml = DicomXmlSerializer.Serialize(dcm.Dataset);
    writer.Write(xml);
}

Дополнительная информация

  • Формат XML обеспечивает лучшую человеческую читаемость с правильной индентацией.
  • XML более вербально, чем JSON, что приводит к большим размерам файлов.
  • Рассмотрим компрессию для хранения или передачи больших XML-файлов.
  • Как JSON, так и XML поддерживают те же типы и структуры данных DICOM.

Заключение

Этот урок продемонстрировал, как конвертировать файлы DICOM в XML-формат и десертизировать XML обратно в C# с помощью Aspose.Medical. XML сериализация необходима для интеграции с наследственными системами здравоохранения и средами, которые зависят от инструмента XML и рабочих потоков.

 Русский