Aspose.Medical DICOM Anonymizer для базы знаний .NET
Как анонимизировать папку исследований DICOM

Как анонимизировать папку исследований DICOM

Этот урок показывает, как анонимизировать несколько файлов DICOM из папки с использованием C#. При работе с сотнями или тысячами медикаментозных изображений, обработка пакета необходима для эффективности и консистенции.

Преимущества анонимизации Batch

  • Эффективность:- Процесс целых исследований или архивов в одной операции.

  • Консистенция:- Используйте те же правила анонимности для всех файлов.

  • Автоматизация:- Интегрировать в автоматизированные рабочие потоки и трубопроводы.

Преимущества: Подготовка к окружающей среде

  • Настройка Visual Studio или любой совместимый .NET IDE.
  • Создайте новый проект приложения .NET 8 для консоли.
  • Инсталляция Aspose.Medical из NuGet Package Manager.
  • Подготовите входную папку с файлами DICOM и создайте выходной папки.

Step-by-Step Guide to Batch Anonymize DICOM файлы

Шаг 1: Инсталляция Aspose.Medical

Добавьте в свой проект библиотеку Aspose.Medical с помощью NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Шаг 2: Включение необходимых номенклатур

Добавьте ссылки на требуемые именные пространства в вашем коде.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Шаг 3: Настройка каталоговых путей

Определите свой входный и выходный каталог маршрутов.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Шаг 4: Перечислить файлы DICOM

Получите все файлы DICOM из входного каталога, включая поддиректоры.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Шаг 5: Создайте анонимизатор

Создайте анонимизатор с желаемым профилем.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Шаг 6: Процесс каждого файла

Пройдите через каждый файл, анонимизируйте его и сохраните в каталог выхода.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Полный пример кода для анонимизации бач

Вот полный пример демонстрации анонимности комплекса с докладом о прогрессе:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Параллельная обработка для лучшей производительности

Для больших наборов данных используйте параллельную обработку, чтобы использовать несколько процессоров:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Улучшенная версия с регистрацией

Для производственной среды, реализуйте правильный логинг:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Лучшие практики для обработки батарей

  • Продолжайте копировать данные: всегда обрабатывайте копию ваших первоначальных данных, а не самих оригиналов.
  • Log All Operations: Сохранить подробные записи, из которых были обработаны файлы и возникли любые ошибки.
  • Первый тест: перед обработкой всего набора данных выполните небольшой выборку.
  • Monitor Disk Space: обеспечивает достаточное пространство на диске для выхода файлов.
  • Перерывывания торговли: Рассмотрим внедрение функциональности точек проверки/резума для очень больших комплектов.

Troubleshooting

Проблемы памяти с большими наборами данных

Для очень больших файлов или наборов данных, обрабатывать файлы один за одним, не сохраняя ссылок:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Ошибки разрешения

Убедитесь, что ваша заявка прочитал доступ к входной директории и написал доступ на выходную директорыю.

Заключение

Этот урок показал, как отслеживать файлы DICOM в C# с использованием Aspose.Medical. Независимо от того, обрабатывая сотни или тысячи файлов, подход отбор обеспечивает последовательную анонимизацию по всему вашему набору данных, при этом обеспечивая мониторинг прогресса и обработку ошибок для надежности производства.

 Русский