Como Anonimizar um Folheto de Estudos DICOM
Este tutorial demonstra como anonimizar vários arquivos DICOM de uma pasta usando C#. Ao trabalhar com centenas ou milhares de ficheiros de imagem médica, o processamento de batch é essencial para eficiência e consistência.
Benefícios da Anonimização de Batch
Eficiência:- Processar todos os estudos ou arquivos em uma única operação.
Consistência:- Aplique as mesmas regras de anonimato para todos os arquivos.
Automação:- Integração em fluxos de trabalho automatizados e tubos.
Título: Preparando o Meio Ambiente
- Instale o Visual Studio ou qualquer .NET IDE compatível.
- Crie um novo projeto de aplicação .NET 8 console.
- Instale Aspose.Medical do NuGet Package Manager.
- Prepare a pasta de entrada com os arquivos DICOM e crie um folder de saída.
Guia passo a passo para Batch Anonimize DICOM arquivos
Passo 1: Instalar Aspose.Medical
Adicione a Aspose.Medical Library ao seu projeto usando NuGet.
Install-Package Aspose.MedicalPasso 2: Incluir os espaços de nome necessários
Adicione referências aos espaços de nomes necessários em seu código.
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;Passo 3: Configurar Paths de Directory
Defina os seus caminhos de entrada e saída.
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);Passo 4: Enumerar arquivos DICOM
Obtenha todos os arquivos DICOM do directorio de entrada, incluindo subdirectores.
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
inputDirectory,
"*.dcm",
SearchOption.AllDirectories
);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");Passo 5: Crie o anonimato
Crie um anonimato com o seu perfil desejado.
Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
// ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);Passo 6: Processar cada arquivo
Passe por cada arquivo, anonimizá-lo e salve para o directorio de saída.
int successCount = 0;
int failCount = 0;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
try
{
// Load DICOM file
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
// Anonymize
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
// Preserve relative directory structure
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
// Ensure subdirectory exists
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
// Save anonymized file
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
}
}
Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");Exemplo de código completo para anonimização de batch
Aqui está um exemplo completo de demonstração de anonimato de batch com relatórios de progresso:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");
// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();
int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
try
{
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
// Progress reporting
double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
}
}
Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");Processamento paralelo para melhor desempenho
Para grandes conjuntos de dados, use processamento paralelo para aproveitar vários núcleos CPU:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");
// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();
// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
try
{
// Each thread gets its own anonymizer instance
Anonymizer anonymizer = new();
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
{
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
}
anonymizedDcm.Save(outputPath);
Interlocked.Increment(ref successCount);
}
catch (Exception ex)
{
Interlocked.Increment(ref failCount);
failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
}
});
Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
if (failedFiles.Any())
{
Console.WriteLine($"\nFailed files:");
foreach (string failure in failedFiles)
{
Console.WriteLine($" - {failure}");
}
}Versão melhorada com logging
Para ambientes de produção, implementar o logging adequado:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();
logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");
int successCount = 0;
int failCount = 0;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
try
{
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
}
}
logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");
// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);
Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");Melhores práticas para processamento de batch
- Run on Copy of Data: Sempre processar uma cópia dos seus dados originais, não os próprios.
- Logo Todas as Operações: Mantenha logs detalhados dos quais os arquivos foram processados e quaisquer erros encontrados.
- Test First: execute uma amostra pequena antes de processar todo o conjunto de dados.
- Monitor Disk Space: Assegura espaço de disco suficiente para os arquivos de saída.
- Handle Interruptions: Considere implementar a funcionalidade de checkpoint/resume para batches muito grandes.
Troubleshooting
Problemas de memória com grandes dados
Para arquivos muito grandes ou conjuntos de dados, processar os ficheiros um a um sem manter referências:
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
{
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
}
// Files are disposed after each iteration
}Erros de permissão
Certifique-se de que o seu aplicativo leu o acesso ao diretório de entrada e escreva acesso à diretoria de saída.
Conclusão
Este tutorial demonstrou como combinar anonimizações de arquivos DICOM em C# usando Aspose.Medical. Se processando centenas ou milhares de ficheiros, a abordagem de combinação assegura uma anonimizada consistente em todo o seu conjunto de dados, ao mesmo tempo que fornece rastreamento do progresso e tratamento de erros para a confiabilidade da produção.