Como Anonimizar um Folheto de Estudos DICOM

Como Anonimizar um Folheto de Estudos DICOM

Este tutorial demonstra como anonimizar vários arquivos DICOM de uma pasta usando C#. Ao trabalhar com centenas ou milhares de ficheiros de imagem médica, o processamento de batch é essencial para eficiência e consistência.

Benefícios da Anonimização de Batch

  • Eficiência:- Processar todos os estudos ou arquivos em uma única operação.

  • Consistência:- Aplique as mesmas regras de anonimato para todos os arquivos.

  • Automação:- Integração em fluxos de trabalho automatizados e tubos.

Título: Preparando o Meio Ambiente

  • Instale o Visual Studio ou qualquer .NET IDE compatível.
  • Crie um novo projeto de aplicação .NET 8 console.
  • Instale Aspose.Medical do NuGet Package Manager.
  • Prepare a pasta de entrada com os arquivos DICOM e crie um folder de saída.

Guia passo a passo para Batch Anonimize DICOM arquivos

Passo 1: Instalar Aspose.Medical

Adicione a Aspose.Medical Library ao seu projeto usando NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Passo 2: Incluir os espaços de nome necessários

Adicione referências aos espaços de nomes necessários em seu código.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Passo 3: Configurar Paths de Directory

Defina os seus caminhos de entrada e saída.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Passo 4: Enumerar arquivos DICOM

Obtenha todos os arquivos DICOM do directorio de entrada, incluindo subdirectores.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Passo 5: Crie o anonimato

Crie um anonimato com o seu perfil desejado.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Passo 6: Processar cada arquivo

Passe por cada arquivo, anonimizá-lo e salve para o directorio de saída.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Exemplo de código completo para anonimização de batch

Aqui está um exemplo completo de demonstração de anonimato de batch com relatórios de progresso:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Processamento paralelo para melhor desempenho

Para grandes conjuntos de dados, use processamento paralelo para aproveitar vários núcleos CPU:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Versão melhorada com logging

Para ambientes de produção, implementar o logging adequado:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Melhores práticas para processamento de batch

  • Run on Copy of Data: Sempre processar uma cópia dos seus dados originais, não os próprios.
  • Logo Todas as Operações: Mantenha logs detalhados dos quais os arquivos foram processados e quaisquer erros encontrados.
  • Test First: execute uma amostra pequena antes de processar todo o conjunto de dados.
  • Monitor Disk Space: Assegura espaço de disco suficiente para os arquivos de saída.
  • Handle Interruptions: Considere implementar a funcionalidade de checkpoint/resume para batches muito grandes.

Troubleshooting

Problemas de memória com grandes dados

Para arquivos muito grandes ou conjuntos de dados, processar os ficheiros um a um sem manter referências:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Erros de permissão

Certifique-se de que o seu aplicativo leu o acesso ao diretório de entrada e escreva acesso à diretoria de saída.

Conclusão

Este tutorial demonstrou como combinar anonimizações de arquivos DICOM em C# usando Aspose.Medical. Se processando centenas ou milhares de ficheiros, a abordagem de combinação assegura uma anonimizada consistente em todo o seu conjunto de dados, ao mesmo tempo que fornece rastreamento do progresso e tratamento de erros para a confiabilidade da produção.

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