Aspose.Medical DICOM Anonymizer dla bazy wiedzy .NET
Jak zarejestrować anonimowy folder studiów DICOM

Jak zarejestrować anonimowy folder studiów DICOM

Ten tutorial pokazuje, jak zbić anonimowe pliki DICOM z folderu za pomocą C#. Kiedy pracujesz z setkami lub tysiącami plików obrazowych medycznych, przetwarzanie zestawu jest niezbędne dla efektywności i spójności.

Korzyści z anonimowości Batch

  • efektywność:- Przetwarzanie wszystkich badań lub archiwów w jednej operacji.

  • Konsekwencja:- Stosuj te same zasady anonimowości do wszystkich plików.

  • automatyzacja:- Integruj się w automatyczne przepływy robocze i rurociągi.

Wymagania: przygotowanie środowiska

  • Zainstaluj program Visual Studio lub dowolny kompatybilny .NET IDE.
  • Stwórz nowy projekt aplikacji konsoli .NET 8.
  • Instaluj Aspose.Medical z programu NuGet Package Manager.
  • Przygotuj folder wejścia z plikami DICOM i utwórz folder wyjścia.

Krok po kroku Przewodnik po anonimowości plików DICOM

Krok 1: Instalacja Aspose.Medical

Dodaj do projektu bibliotekę Aspose.Medical za pomocą NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Krok 2: Włącz niezbędne przestrzenie nazwowe

Dodaj odniesienia do wymaganych przestrzeni nazwowych w kodzie.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Krok 3: Ustaw drogi katalogowe

Określ swoje ścieżki dyrektora wejścia i wyjścia.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Krok 4: Podsumowanie plików DICOM

Uzyskaj wszystkie pliki DICOM z dyrektora wejściowego, w tym poddyrektory.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Krok 5: Tworzenie anonimowego

Stwórz instancję Anonymizator z pożądanymi profilami.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Krok 6: Przetwarzanie każdego pliku

Przejdź przez każdy plik, anonimizuj go i przechowuj do katalogu wyjścia.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Pełny przykład kodu dla anonimowości batch

Oto kompletny przykład demonstracji anonimowości z raportami o postępach:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Równoległe przetwarzanie dla lepszej wydajności

W przypadku dużych zestawów danych, użyj równoległego przetwarzania do wykorzystania wielu węzłów CPU:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Wzmocniona wersja z logowaniem

Dla środowisk produkcyjnych, wdrożenie odpowiedniego logowania:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Najlepsze metody przetwarzania batchów

  • Run on Copy of Data: Zawsze przetwarza kopię oryginalnych danych, a nie samych oryginałów.
  • Zarejestruj wszystkie operacje: Utrzymuj szczegółowe dzienniki, z których zostały przetwarzane pliki i wszelkie błędy.
  • Test First: Przeprowadź małą próbkę przed przetwarzaniem całego zestawu danych.
  • Monitor Disk Space: Zapewnij wystarczającą ilość miejsca na dysk dla plików wyjściowych.
  • Przerwy handlowe: Rozważ wdrożenie funkcji punktów kontrolnych/resume dla bardzo dużych partii.

Troubleshooting

Problemy z pamięcią z dużymi zestawami danych

W przypadku bardzo dużych plików lub zestawów danych przetwarzamy pliki raz na jakiś czas bez przechowywania odniesień:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

błędy pozwolenia

Upewnij się, że Twoja aplikacja przeczyta dostęp do katalogu wejściowego i napisz dostęp na katalog wyjściowy.

konkluzja

Ten tutorial wykazał, jak zbić anonimowe pliki DICOM w C# za pomocą Aspose.Medical. Niezależnie od tego, czy przetwarza setki lub tysiące plików, podejście zbiorcze zapewnia konsekwentną anonymię w całym zestawie danych, jednocześnie zapewniając śledzenie postępów i zarządzanie błędami dla wiarygodności produkcji.

 Polski