Aspose.Medical DICOM til Text Converter for .NET Knowledge Base
Hvordan konvertere flere DICOM-filer til en enkelt JSON-array

Hvordan konvertere flere DICOM-filer til en enkelt JSON-array

Denne veiledningen viser hvordan du konverterer flere DICOM-filer til en enkelt JSON-array ved hjelp av C#. Denne tilnærmingen er ideell for data ingeniører som trenger å eksportere metadata til analytiske verktøy, databaser eller data pipeliner.

Fordelene med JSON Array Export

  • Bulk databehandling:- Importerer flere DICOM-opplysninger til databaser i en enkelt operasjon.

    • Analytiker er klar:- JSON-rays kan lastes direkte inn i Python, Spark eller data lagre.
    • Kompakte utganger *:- Enkel fil som inneholder alle metadata forenkler datahåndtering.

Forutsetninger: Å forberede miljøet

  • Installer Visual Studio eller noe kompatibelt .NET IDE.
  • Skap et nytt .NET 8 konsolapplikasjon prosjekt.
  • Installere Aspose.Medical fra NuGet Package Manager.
  • Forbered en mappe som inneholder flere DICOM-filer.

Step-by-Step Guide for å konvertere flere DICOM-filer til JSON Array

Steg 1: Installere Aspose.Medical

Legg til Aspose.Medical Library til prosjektet ditt ved hjelp av NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Steg 2: Inkludere nødvendige navnområder

Legg til referanser til de nødvendige navnene i koden din.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

Trinn 3: Last ned flere DICOM-filer

Last ned DICOM-filer fra en mappe til en samling.

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
}

Steg 4: Extract Dataset Array

Bygg en rekke Dataset-objekter fra de lastede filene.

Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

Steg 5: Serialiser til JSON Array

Use DicomJsonSerializer.Serialize med dataset array.

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

Steg 6: Spare JSON Array

Lagre JSON array til en fil.

File.WriteAllText("dicom_studies.json", jsonArray);
Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} DICOM datasets to JSON array.");

Komplett kode eksempler

Her er et komplett eksempel som viser hvordan du konverterer flere DICOM-filer til en JSON-array:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string outputFile = "dicom_studies.json";

// Get all DICOM files
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
Console.WriteLine($"Found {dicomPaths.Length} DICOM files.");

// Load all files
List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Skipping invalid file: {Path.GetFileName(path)}");
    }
}

// Build dataset array
Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

// Serialize to JSON array
string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

// Save to file
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Successfully exported {datasets.Length} datasets to {outputFile}");

Eksempel på JSON Array Output

Produksjonen av JSON array ser slik ut:

[
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "DOE^JOHN" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["12345"] }
  },
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "SMITH^JANE" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["67890"] }
  }
]

Behandling av store datasett med LINQ

For bedre hukommelsesstyring med store datasett, bruk LINQ-prognoser:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\LargeDicomArchive";
string outputFile = "large_export.json";

// Process files lazily to manage memory
Dataset[] datasets = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm")
    .Select(path => 
    {
        try
        {
            return DicomFile.Open(path).Dataset;
        }
        catch
        {
            return null;
        }
    })
    .Where(ds => ds != null)
    .ToArray()!;

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} datasets.");

Legg til Progress Reporting

For store partier, legge til fremgangsrapportering:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<Dataset> datasets = new();
int processed = 0;
int total = dicomPaths.Length;

foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(path);
        datasets.Add(dcm.Dataset);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Error: {Path.GetFileName(path)} - {ex.Message}");
    }
    
    processed++;
    if (processed % 100 == 0 || processed == total)
    {
        Console.WriteLine($"Progress: {processed}/{total} ({processed * 100 / total}%)");
    }
}

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets.ToArray(), writeIndented: true);
File.WriteAllText("export.json", jsonArray);

Console.WriteLine($"Export complete: {datasets.Count} datasets.");

Importerer JSON Array til Analytics-verktøy

Python eksempler 

import json
import pandas as pd

# Load the exported JSON array
with open('dicom_studies.json', 'r') as f:
    dicom_data = json.load(f)

# Convert to DataFrame for analysis
df = pd.json_normalize(dicom_data)
print(df.head())

Last ned til MongoDB 

// Using mongoimport
// mongoimport --db medical --collection studies --jsonArray --file dicom_studies.json

Memoriale vurderinger

Når du arbeider med svært store datasett:

  • Prosess i Batches: Split filer i batcher av 100-500 filene.
  • Stream Output: Bruk strømbasert serialisering for svært store arrayer.
  • Dispose Files: Sørg for at DicomFile-objektene blir fjernet etter utvinning av datasett.
// Batch processing example
int batchSize = 100;
string[] allFiles = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
int batchNumber = 0;

for (int i = 0; i < allFiles.Length; i += batchSize)
{
    string[] batch = allFiles.Skip(i).Take(batchSize).ToArray();
    Dataset[] datasets = batch
        .Select(path => DicomFile.Open(path).Dataset)
        .ToArray();
    
    string batchJson = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
    File.WriteAllText($"batch_{batchNumber++}.json", batchJson);
}

Ytterligere informasjon

  • JSON array-format er ideelt for masseimport til NoSQL-databaser.
  • Tenk på å komprimere store JSON-filer for lagringseffektivitet.
  • For streaming scenarier, tenk å bruke NDJSON (newline-delimited JSON) format i stedet.

Conclusion

Denne veiledningen har vist deg hvordan du konverterer flere DICOM-filer til en enkelt JSON-array i C# ved hjelp av Aspose.Medical. Denne tilnærmingen gjør det mulig å effektivt eksportere massedata for analyse, databaseimport og data pipeline integrasjon.

 Norsk