Aspose.Medical DICOM Anonymizer untuk pangkalan pengetahuan .NET

Bagaimana untuk menggabungkan anonim folder kajian DICOM

Tutorial ini menunjukkan bagaimana untuk membungkus anonim pelbagai fail DICOM daripada folder menggunakan C#. Apabila bekerja dengan beratus-ratus atau beribu-ribu fail imej perubatan, pemprosesan batch adalah penting untuk kecekapan dan konsistensi.

Kelebihan Anonymisasi Batch

Keselamatan dan keberkesanan:- Proses keseluruhan kajian atau arkib dalam satu operasi.
Keserasian:- Gunakan peraturan anonim yang sama kepada semua fail.
Perkhidmatan Automatik:- Mengintegrasikan ke dalam aliran kerja dan paip automatik.

Tag: persiapan persekitaran

Menyediakan Visual Studio atau mana-mana .NET IDE yang kompatibel.
Mencipta projek aplikasi .NET 8 baru.
Instal Aspose.Medical daripada NuGet Package Manager.
Sediakan folder input dengan fail DICOM dan mencipta folder output.

Langkah-langkah Panduan untuk Batch Anonimkan Fail DICOM

Langkah 1: Instal Aspose.Medical

Tambah perpustakaan Aspose.Medical kepada projek anda menggunakan NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Langkah 2: Masukkan ruang nama yang diperlukan

Tambah rujukan kepada ruang nama yang diperlukan dalam kod anda.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Langkah 3: Menetapkan laluan direktori

Menetapkan laluan direktori input dan output anda.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Langkah 4: Menyenaraikan fail DICOM

Dapatkan semua fail DICOM daripada direktori input, termasuk subdirektori.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Langkah 5: Mencipta Anonim

Mencipta contoh Anonymizer dengan profil yang anda inginkan.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Langkah 6: Memproses setiap fail

Melompat melalui setiap fail, anonimkan dan simpan ke direktori output.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Contoh Kod Lengkap untuk Anonimiti Batch

Berikut ialah contoh lengkap menunjukkan anonimiti batch dengan laporan kemajuan:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Pemprosesan paralel untuk prestasi yang lebih baik

Untuk set data yang besar, gunakan pemprosesan serentak untuk memanfaatkan pelbagai teras CPU:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Versi yang diperbaiki dengan logging

Untuk persekitaran pengeluaran, melaksanakan logging yang betul:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Praktik terbaik untuk pemprosesan batch

Run on Copy of Data: Sentiasa memproses salinan data asal anda, bukan asal-usul itu sendiri.
Log Semua Operasi: Simpan log terperinci yang mana fail telah diproses dan sebarang kesilapan yang ditemui.
Test First: Berjalan pada sampel kecil sebelum memproses keseluruhan set data.
Monitor Disk Space: Memastikan ruang cakera yang mencukupi untuk fail output.
Handle Interruptions: Pertimbangkan untuk melaksanakan fungsi checkpoint/resume untuk batch yang sangat besar.

Troubleshooting

Masalah memori dengan data besar

Untuk fail yang sangat besar atau set data, memproses fail satu demi satu tanpa mengekalkan rujukan:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Kesilapan Permohonan

Pastikan permohonan anda telah membaca akses ke direktori input dan menulis akses kepada direktor output.

Conclusion

Tutorial ini telah menunjukkan bagaimana untuk membungkus anonim fail DICOM dalam C# menggunakan Aspose.Medical. Sama ada memproses beratus-ratus atau beribu-ribu fail, pendekatan pembungkusan memastikan anonymisasi yang konsisten di seluruh set data anda sambil menyediakan pengesanan kemajuan dan pengendalian ralat untuk kebolehpercayaan pengeluaran.