Aspose.Medical DICOM Anonymizer .NET Zināšanu bāzei
Kā apvienot anonimizēt DICOM pētījumu mapes

Kā apvienot anonimizēt DICOM pētījumu mapes

Šis apmācība parāda, kā anonimizēt vairākas DICOM failus no mapes, izmantojot C#. Kad strādā ar simtiem vai tūkstošiem medicīnisko attēlu failiem, batch apstrāde ir svarīga efektivitātes un konsekvences nodrošināšanai.

Batch anonimizācijas priekšrocības

  • Efektivitāte:- Visu pētījumu vai arhīvu apstrāde vienā darbībā.

  • Konsistence ir:- Piemērojiet tos pašus anonimizācijas noteikumus visiem failiem.

  • Automašīna ir:- Integrēties automatizētajos darba plūsmos un caurulēs.

Priekšnoteikumi: Vides sagatavošana

  • Iestatīt Visual Studio vai jebkuru saderīgu .NET IDE.
  • Izveidojiet jaunu .NET 8 konsoles lietojumprogrammu projektu.
  • Instalējiet Aspose.Medical no NuGet Package Manager.
  • Sagatavojiet ieejas mapes ar DICOM failiem un izveidojiet iznākuma mapi.

Step-by-Step Guide to Batch Anonymize DICOM faili

1. solis: instalēt Aspose.Medical

Pievienojiet Aspose.Medicīnas bibliotēku savam projektam, izmantojot NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

2. solis: Iekļaut nepieciešamos nosaukuma telpas

Pievienojiet atsauces uz pieprasītajiem nosaukuma telpām savā kodā.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

3. solis: iestatīt adreses maršrutus

Nosakiet ieejas un iznākumu direktorijas maršrutus.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

4. solis: uzskaitīt DICOM failus

Iegūstiet visus DICOM failus no ieejas direktorijas, ieskaitot apakšdirektorijas.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

5. solis: izveidojiet anonimizatoru

Izveidojiet Anonymizatoru ar vēlamo profilu.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

6. solis: Katru failu apstrāde

Izlaidiet katru failu, anonimizējiet to un glabājiet to izejas direktorijā.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Pilns koda piemērs batch anonimizācijai

Šeit ir pilns piemērs, kas demonstrē batch anonimizāciju ar progresa ziņošanu:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Paralēli apstrādi, lai uzlabotu veiktspēju

Lieliem datu komplektiem izmanto paralēli apstrādi, lai izmantotu vairākus CPU kodus:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Uzlabota versija ar logging

Ražošanas videi, ieviešot pareizo logging:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Labākās prakses batch apstrādei

  • Run on Copy of Data: Vienmēr apstrādā savu oriģinālo datu kopiju, nevis pašu oriģijas.
  • Log Visas darbības: Saglabājiet detalizētus logus, no kuriem tika apstrādāti faili un radušās kļūdas.
  • Test First: Izveidojiet nelielu paraugu pirms visu datu kopumu apstrādes.
  • Monitor Disk Space: nodrošina pietiekamu disku telpu izkraušanas failiem.
  • Handle Interruptions: Apsveriet pārbaudes punkta/recepcijas funkcionalitātes ieviešanu ļoti lielām partijām.

Troubleshooting

Atmiņas problēmas ar lieliem datu komplektiem

Ļoti lieliem failiem vai datu komplektiem, apstrādā failus vienu reizi, neuzglabājot atsauces:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Atļaujas kļūdas

Pārliecinieties, ka jūsu lietojumprogramma ir izlasījusi piekļuvi ieejas direktorijai un rakstīja piekļuves ievadīšanas direktorijā.

Conclusion

Šis apmācība ir parādījusi, kā apvienot anonimizēt DICOM failus C#, izmantojot Aspose.Medical. Neatkarīgi no tā, vai apstrādā simtiem vai tūkstošiem failu, apvienošanas pieeja nodrošina konsekventu anonimitāti visā jūsu datu komplektā, vienlaikus nodrošinot progresa izsekojumu un kļūdu apstrādi ražošanas uzticamību.

 Latviski