Az ASPOSE.MEDICAL DICOM a .NET Tudásbázis szövegfordítójához
Hogyan lehet több DICOM fájlt egyetlen JSON arrayba átalakítani

Hogyan lehet több DICOM fájlt egyetlen JSON arrayba átalakítani

Ez a kézikönyv azt mutatja, hogyan lehet több DICOM fájlt egyetlen JSON sorba átalakítani a C# használatával.Ez a megközelítés ideális az adatmérnökök számára, akiknek exportálniuk kell a DIKOM metadatait elemzési eszközök, adatbázisok vagy adatcsatornák számára.

JSON Array export előnyei

    • Az adatkezelés folyamata *:- Több DICOM rekord importálása egyetlen műveletben adatbázisokba.

  • Az elemzők készek:- A JSON fájlokat közvetlenül a Python, a Spark vagy az adatok raktáraiba lehet feltölteni.

    • Kompatibilis kimenetel*- Az összes metadata tartalmazó egyetlen fájl egyszerűsíti az adatkezelést.

Előfeltételek: a környezet előkészítése

  • A Visual Studio vagy bármely kompatibilis .NET IDE beállítása.
  • Hozzon létre egy új .NET 8 konzol alkalmazási projektet.
  • Telepítse az Aspose.Medical-t a NuGet csomagkezelőből.
  • Készítsen egy mappát, amely több DICOM fájlt tartalmaz.

Lépésről lépésre útmutató a több DICOM fájl átalakítására JSON array

1. lépés: Install Aspose.Medical

Add hozzá az Aspose.Medical könyvtárat a projekthez a NuGet használatával.

Install-Package Aspose.Medical

2. lépés: Tartalmazza a szükséges névterületeket

Hozzáadjon hivatkozásokat a szükséges névterületekhez a kódjában.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

3. lépés: Több DICOM fájl feltöltése

Töltse le a DICOM fájlokat egy mappából egy gyűjteménybe.

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
}

4. lépés: Dataset Array kivonat

Hozzon létre egy sor Dataset objektumokat a feltöltött fájlokból.

Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

5. lépés: Serializáljuk a JSON Array-t

Használat DicomJsonSerializer.Serialize A Dataset array.

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

6. lépés: mentse meg a JSON array

Mentse a JSON array-t egy fájlra.

File.WriteAllText("dicom_studies.json", jsonArray);
Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} DICOM datasets to JSON array.");

Teljes kódex példája

Íme egy teljes példa, amely bemutatja, hogyan lehet több DICOM fájlt egy JSON sorba konvertálni:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string outputFile = "dicom_studies.json";

// Get all DICOM files
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
Console.WriteLine($"Found {dicomPaths.Length} DICOM files.");

// Load all files
List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Skipping invalid file: {Path.GetFileName(path)}");
    }
}

// Build dataset array
Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

// Serialize to JSON array
string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

// Save to file
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Successfully exported {datasets.Length} datasets to {outputFile}");

JSON array kimenetel

A JSON array kimenete így néz ki:

[
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "DOE^JOHN" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["12345"] }
  },
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "SMITH^JANE" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["67890"] }
  }
]

Nagy adatbázisok feldolgozása a LINQ segítségével

A memória jobb kezeléséhez nagy adatkészülékekkel LINQ projekciókat használjon:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\LargeDicomArchive";
string outputFile = "large_export.json";

// Process files lazily to manage memory
Dataset[] datasets = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm")
    .Select(path => 
    {
        try
        {
            return DicomFile.Open(path).Dataset;
        }
        catch
        {
            return null;
        }
    })
    .Where(ds => ds != null)
    .ToArray()!;

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} datasets.");

A haladás jelentése

Nagy mérkőzések esetén adjunk előrejelzést:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<Dataset> datasets = new();
int processed = 0;
int total = dicomPaths.Length;

foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(path);
        datasets.Add(dcm.Dataset);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Error: {Path.GetFileName(path)} - {ex.Message}");
    }
    
    processed++;
    if (processed % 100 == 0 || processed == total)
    {
        Console.WriteLine($"Progress: {processed}/{total} ({processed * 100 / total}%)");
    }
}

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets.ToArray(), writeIndented: true);
File.WriteAllText("export.json", jsonArray);

Console.WriteLine($"Export complete: {datasets.Count} datasets.");

A JSON Array importálása az Analytics eszközökbe

Python példa 

import json
import pandas as pd

# Load the exported JSON array
with open('dicom_studies.json', 'r') as f:
    dicom_data = json.load(f)

# Convert to DataFrame for analysis
df = pd.json_normalize(dicom_data)
print(df.head())

Letöltés a MongoDB-re 

// Using mongoimport
// mongoimport --db medical --collection studies --jsonArray --file dicom_studies.json

Memória megfontolások

Amikor nagyon nagy adatkészülékekkel dolgozunk:

  • Megfolyamat Batches: Fájlokat 100-500 fájlt tartalmazó batchokba osztunk.
  • Stream Output: Az áramalapú serializáció használata nagyon nagy sávokhoz.
  • Fájlok elhelyezése: Győződjön meg róla, hogy a DicomFile objektumok eltávolításra kerülnek az adatkészletek kivonása után.
// Batch processing example
int batchSize = 100;
string[] allFiles = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
int batchNumber = 0;

for (int i = 0; i < allFiles.Length; i += batchSize)
{
    string[] batch = allFiles.Skip(i).Take(batchSize).ToArray();
    Dataset[] datasets = batch
        .Select(path => DicomFile.Open(path).Dataset)
        .ToArray();
    
    string batchJson = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
    File.WriteAllText($"batch_{batchNumber++}.json", batchJson);
}

További információk

  • A JSON array formátum ideális a NoSQL adatbázisok tömeges behozatalához.
  • Fontolja meg a nagy JSON fájlok tömörítését a tárolási hatékonyság érdekében.
  • Streaming forgatókönyvek, fontolja meg a NDJSON (newline-delimited JSON) formátum helyett.

következtetések

Ez a kézikönyv megmutatta, hogyan lehet több DICOM fájlt egyetlen JSON sorba átalakítani a C#-ban az Aspose.Medical használatával.Ez a megközelítés lehetővé teszi a hatékony tömeges adatek exportját az elemzéshez, az adatbázisok behozatalához és az adatok csővezeték integrációjához.

 Magyar