Aspose.Medical DICOM Anonymizer a .NET Tudásbázishoz
Hogyan készítsünk egy DICOM tanulmányok mappáját

Hogyan készítsünk egy DICOM tanulmányok mappáját

Ez a kézikönyv azt mutatja, hogyan lehet anonimizálni a több DICOM fájlokat egy C#-t használó mappából. Amikor több száz vagy több ezer orvosi képfájlt dolgozunk, a csomagkezelés elengedhetetlen a hatékonyság és a következetesség szempontjából.

A Batch Anonymizáció előnyei

  • Hatékonyság:- A teljes tanulmányok vagy archívumok egyetlen műveletben történő feldolgozása.

  • A következetesség:- Ugyanazokat az anonimizációs szabályokat alkalmazza az összes fájlra.

  • Az automatizálás:- Integráljon automatizált munkafolyamatokba és csővezetékekbe.

Előfeltételek: a környezet előkészítése

  • A Visual Studio vagy bármely kompatibilis .NET IDE beállítása.
  • Hozzon létre egy új .NET 8 konzol alkalmazási projektet.
  • Telepítse az Aspose.Medical-t a NuGet csomagkezelőből.
  • Készítsen beviteli mappát a DICOM fájlokkal, és hozzon létre egy kimeneti foldert.

Lépésről lépésre útmutató a DICOM fájlok anonimizálására

1. lépés: Install Aspose.Medical

Add hozzá az Aspose.Medical könyvtárat a projekthez a NuGet használatával.

Install-Package Aspose.Medical

2. lépés: Tartalmazza a szükséges névterületeket

Hozzáadjon hivatkozásokat a szükséges névterületekhez a kódjában.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

3. lépés: Állítsa be a katalógus útvonalát

Határozza meg a be- és kimeneti címkével kapcsolatos útvonalakat.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

4. lépés: A DICOM fájlok listája

Szerezze meg az összes DICOM fájlt a beviteli kézikönyvből, beleértve a mellékhelyeket is.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

5. lépés: Hozza létre az Anonymizálót

Hozzon létre egy Anonymizáló példát a kívánt profiljával.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

6. lépés: Minden fájl feldolgozása

Menj át minden fájlt, anonimizálja, és mentse a kimeneti kézikönyv.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Teljes kódmintája a Batch Anonymizáláshoz

Íme egy teljes példa, amely demonstrálja az anonimizációt a haladásról szóló jelentéssel:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

párhuzamos feldolgozás a jobb teljesítmény érdekében

Nagy adatkészletek esetében használjon párhuzamos feldolgozást a több CPU-kór használatához:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Továbbfejlesztett verzió logging

A termelési környezetekhez a megfelelő naplózás végrehajtása:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

A legjobb gyakorlatok a batch feldolgozáshoz

  • Adatok másolása: Az eredeti adatok mindig másolatát feldolgozza, nem pedig az eredeti adatokat.
  • Log All Operations: Tartsa a feldolgozott fájlok részletes logjait és bármilyen hibát.
  • Test First: A teljes adatkészlet feldolgozását megelőzően egy kis mintán fut.
  • Monitor Disk Space: Megfelelő lemezterületet biztosít a kimeneti fájlokhoz.
  • Handle Interruptions: Figyelembe kell venni a checkpoint/resume funkciók végrehajtását nagyon nagy darabokra.

Troubleshooting

Memória problémák nagy adatkészülékekkel

A nagyon nagy fájlok vagy adatkészletek esetében a Fájlokat egyszerre feldolgozzuk anélkül, hogy referenciákat tartanánk:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Engedély hibák

Győződjön meg róla, hogy az alkalmazás olvassa el a beviteli kézikönyvhez való hozzáférést, és írja be a kimeneti címkét.

következtetések

Ez a kézikönyv megmutatta, hogyan lehet csomagolni anonim DICOM fájlokat C# használatával Aspose.Medical. függetlenül attól, hogy feldolgozása több száz vagy több ezren, a csomagolási megközelítés biztosítja a következetes anonimizáció az egész adatkészletet, miközben előrelépés nyomon követése és hiba kezelése a termelés megbízhatóságát.

 Magyar