Aspose.Medical DICOM to Text Converter za .NET Knowledge Base
Kako pretvoriti više DICOM datoteka u jedinstvenu JSON array

Kako pretvoriti više DICOM datoteka u jedinstvenu JSON array

Ovaj tutorial pokazuje kako pretvoriti više DICOM datoteka u jedinstvenu JSON rasponu pomoću C#. Ovaj pristup je idealan za inženjere podataka koji trebaju izvoziti metapodatke za analitičke alate, baze podataka ili podatkovne cijevi.

Prednosti izvoza JSON Array

  • Obavijest o obradama podataka**:- Uvoz više DICOM zapisa u baze podataka u jednoj operaciji.

  • Analitičari su spremni:- JSON radovi mogu se izravno preuzeti u Python, Spark ili skladišta podataka.

    • Kompaktni izlazak *- Jedinstvena datoteka koja sadrži sve metapodatke pojednostavljuje upravljanje podacima.

Predviđanja: Priprema za okoliš

  • Sastavite Visual Studio ili bilo koji kompatibilni .NET IDE.
  • Stvorite novi .NET 8 konzol aplikacijski projekt.
  • Instalirajte Aspose.Medical iz upravitelja paketa NuGet.
  • Pripremite mapu koja sadrži više DICOM datoteka.

Korak po korak vodič za pretvaranje više DICOM datoteka u JSON Array

Korak 1: Instalirati Aspose.Medical

Dodajte Aspose.Medical knjižnicu u svoj projekt pomoću NuGeta.

Install-Package Aspose.Medical

Korak 2: Uključite potrebne nazivne prostore

Dodajte upute potrebnim nazivnim prostorima u vašem kodu.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

Korak 3: Preuzmite više DICOM datoteka

Preuzmite DICOM datoteke iz mape u zbirku.

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
}

Korak 4: Izvadite Dataset Array

Izgradite niz objekata Dataset iz preuzete datoteke.

Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

Korak 5: Serializirajte se na JSON Array

Korištenje DicomJsonSerializer.Serialize Slijedeći članakDataset array

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

Korak 6: Sačuvajte JSON Array

Sačuvajte JSON array na datoteku.

File.WriteAllText("dicom_studies.json", jsonArray);
Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} DICOM datasets to JSON array.");

Cjeloviti primjer koda

Ovdje je potpuni primjer koji pokazuje kako pretvoriti više DICOM datoteka u JSON raspon:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string outputFile = "dicom_studies.json";

// Get all DICOM files
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
Console.WriteLine($"Found {dicomPaths.Length} DICOM files.");

// Load all files
List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Skipping invalid file: {Path.GetFileName(path)}");
    }
}

// Build dataset array
Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

// Serialize to JSON array
string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

// Save to file
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Successfully exported {datasets.Length} datasets to {outputFile}");

Primjer JSON Array izlaza

Izlazak JSON array izgleda ovako:

[
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "DOE^JOHN" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["12345"] }
  },
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "SMITH^JANE" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["67890"] }
  }
]

Procesiranje velikih datoteka s LINQ-om

Za bolje upravljanje memorijom s velikim skupovima podataka, koristite LINQ projekcije:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\LargeDicomArchive";
string outputFile = "large_export.json";

// Process files lazily to manage memory
Dataset[] datasets = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm")
    .Select(path => 
    {
        try
        {
            return DicomFile.Open(path).Dataset;
        }
        catch
        {
            return null;
        }
    })
    .Where(ds => ds != null)
    .ToArray()!;

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} datasets.");

Dodavanje izvješća o napretku

Za velike bitke, dodajte izvješće o napretku:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<Dataset> datasets = new();
int processed = 0;
int total = dicomPaths.Length;

foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(path);
        datasets.Add(dcm.Dataset);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Error: {Path.GetFileName(path)} - {ex.Message}");
    }
    
    processed++;
    if (processed % 100 == 0 || processed == total)
    {
        Console.WriteLine($"Progress: {processed}/{total} ({processed * 100 / total}%)");
    }
}

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets.ToArray(), writeIndented: true);
File.WriteAllText("export.json", jsonArray);

Console.WriteLine($"Export complete: {datasets.Count} datasets.");

Uvoz JSON Array u analitičke alate

Python primjer 

import json
import pandas as pd

# Load the exported JSON array
with open('dicom_studies.json', 'r') as f:
    dicom_data = json.load(f)

# Convert to DataFrame for analysis
df = pd.json_normalize(dicom_data)
print(df.head())

Preuzimanje u MongoDB 

// Using mongoimport
// mongoimport --db medical --collection studies --jsonArray --file dicom_studies.json

Razmatranje pamćenja

Kada radite s vrlo velikim skupovima podataka:

  • Proces u paketima: Razdvojite datoteke u pakete od 100 do 500 datotek.
  • Stream Output: Koristite serijaliziranje na temelju struje za vrlo velike rasvjete.
  • Postavite datoteke: Uvjerite se da su objekti DicomFile uklonjeni nakon uklanjanja zbirki podataka.
// Batch processing example
int batchSize = 100;
string[] allFiles = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
int batchNumber = 0;

for (int i = 0; i < allFiles.Length; i += batchSize)
{
    string[] batch = allFiles.Skip(i).Take(batchSize).ToArray();
    Dataset[] datasets = batch
        .Select(path => DicomFile.Open(path).Dataset)
        .ToArray();
    
    string batchJson = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
    File.WriteAllText($"batch_{batchNumber++}.json", batchJson);
}

Dodatne informacije

  • JSON array format je idealan za masovni uvoz u NoSQL baze podataka.
  • Razmislite o kompresiranju velikih JSON datoteka za učinkovitost skladištenja.
  • Za prijenos scenarija, razmislite o korištenju NDJSON (newline-delimited JSON) formata umjesto toga.

zaključak

Ovaj tutorial vam je pokazao kako pretvoriti više DICOM datoteka u jedinstvenu JSON rasponu u C# pomoću Aspose.Medical.Ovaj pristup omogućuje učinkovit izvoz masovnih podataka za analizu, uvoz baze podataka i integraciju podatkovnih cijevi.

 Hrvatski