Aspose.Medical DICOM tekstimuunnin .NET Knowledge Base
Miten muuntaa useita DICOM tiedostoja yhdeksi JSON Array

Miten muuntaa useita DICOM tiedostoja yhdeksi JSON Array

Tämä opetusohjelma osoittaa, miten muuntaa useita DICOM-tiedostoja yhdeksi JSON-sarjaksi C#: n avulla. Tämä lähestymistapa on ihanteellinen tietojen insinööreille, joilla on tarpeen viedä Dicom-metatietoja analyyttisiin työkaluihin, tietokantoihin tai tietolähteisiin.

JSON Array Exportin hyödyt

  • ”Bulk Data Processing” tarkoittaa:- Tuoda useita DICOM-tiedostoja tietokantoihin yhdessä toiminnassa.

  • Analyytikot ovat valmiita:- JSON-kappaleet voidaan ladata suoraan Pythoniin, Spark- tai tietovarastoihin.

    • Kompakti tulos *:- Yksi tiedosto, joka sisältää kaikki metatiedot, yksinkertaistaa tietojen hallintaa.

Edellytykset: Ympäristön valmistelu

  • Aseta Visual Studio tai yhteensopiva .NET IDE.
  • Luo uusi .NET 8 -konsolin sovellusprojekti.
  • Asenna Aspose.Medical NuGet Package Managerista.
  • Valmista laatikko, joka sisältää useita DICOM-tiedostoja.

Vaiheittainen opas useiden DICOM-tiedostojen muuntamiseen JSON Array

Vaihe 1: Asenna Aspose.Medical

Lisää Aspose.Medical -kirjasto projektillesi NuGetin avulla.

Install-Package Aspose.Medical

Vaihe 2: Sisällytä tarvittavat nimet

Lisää viittauksia vaadittuihin nimipaikkoihin koodissasi.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

Vaihe 3: Lataa useita DICOM-tiedostoja

Lataa DICOM-tiedostoja kansiosta kokoelmaan.

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
}

Vaihe 4: Poista Dataset Array

Rakenna joukko Dataset-objekteja ladatuista tiedostoista.

Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

Vaihe 5: Serioi JSON Array

Käytä DicomJsonSerializer.Serialize ja dataset array.

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

Vaihe 6: Tallenna JSON Array

Tallenna JSON array tiedostoon.

File.WriteAllText("dicom_studies.json", jsonArray);
Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} DICOM datasets to JSON array.");

Täydellinen esimerkki koodista

Tässä on täydellinen esimerkki siitä, miten muuntaa useita DICOM-tiedostoja JSON-sarjaan:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string outputFile = "dicom_studies.json";

// Get all DICOM files
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
Console.WriteLine($"Found {dicomPaths.Length} DICOM files.");

// Load all files
List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Skipping invalid file: {Path.GetFileName(path)}");
    }
}

// Build dataset array
Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

// Serialize to JSON array
string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

// Save to file
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Successfully exported {datasets.Length} datasets to {outputFile}");

Esimerkki JSON Array Output

JSON Array näyttää tältä:

[
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "DOE^JOHN" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["12345"] }
  },
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "SMITH^JANE" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["67890"] }
  }
]

Suuren datan käsittely LINQ:llä

Parempaan muistin hallintaan suurilla tietokoneilla käytä LINQ-projektioita:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\LargeDicomArchive";
string outputFile = "large_export.json";

// Process files lazily to manage memory
Dataset[] datasets = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm")
    .Select(path => 
    {
        try
        {
            return DicomFile.Open(path).Dataset;
        }
        catch
        {
            return null;
        }
    })
    .Where(ds => ds != null)
    .ToArray()!;

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} datasets.");

Lisätään edistymisraporttia

Suuriin matkoihin lisätään edistymisraportti:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<Dataset> datasets = new();
int processed = 0;
int total = dicomPaths.Length;

foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(path);
        datasets.Add(dcm.Dataset);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Error: {Path.GetFileName(path)} - {ex.Message}");
    }
    
    processed++;
    if (processed % 100 == 0 || processed == total)
    {
        Console.WriteLine($"Progress: {processed}/{total} ({processed * 100 / total}%)");
    }
}

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets.ToArray(), writeIndented: true);
File.WriteAllText("export.json", jsonArray);

Console.WriteLine($"Export complete: {datasets.Count} datasets.");

Tuoda JSON Array Analytics -työkaluihin

Python esimerkki 

import json
import pandas as pd

# Load the exported JSON array
with open('dicom_studies.json', 'r') as f:
    dicom_data = json.load(f)

# Convert to DataFrame for analysis
df = pd.json_normalize(dicom_data)
print(df.head())

Lataa MongoDB 

// Using mongoimport
// mongoimport --db medical --collection studies --jsonArray --file dicom_studies.json

Muistin tarkastelu

Kun työskentelet hyvin suurien tietokoneiden kanssa:

  • Process in Batches: jakaa tiedostot 100–500 tiedostoon.
  • Stream Output: Käytä virranpohjaista sarjakuvausta hyvin suurille kaareille.
  • Lisää Tiedostoja: Varmista, että DicomFile-objekti poistetaan tietokoneiden poistamisen jälkeen.
// Batch processing example
int batchSize = 100;
string[] allFiles = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
int batchNumber = 0;

for (int i = 0; i < allFiles.Length; i += batchSize)
{
    string[] batch = allFiles.Skip(i).Take(batchSize).ToArray();
    Dataset[] datasets = batch
        .Select(path => DicomFile.Open(path).Dataset)
        .ToArray();
    
    string batchJson = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
    File.WriteAllText($"batch_{batchNumber++}.json", batchJson);
}

Lisätietoja

  • JSON Array -muoto on ihanteellinen NoSQL-tietokantojen massatuonnille.
  • Harkitse suurien JSON-tiedostojen puristamista tallennuksen tehokkuuden varmistamiseksi.
  • Streamin skenaarioissa harkitse sen sijaan NDJSON (newline-delimited JSON) -formaatin käyttöä.

johtopäätöksiä

Tämä opetusohjelma on osoittanut sinulle, miten muuntaa useita DICOM-tiedostoja yhdeksi JSON-ryhmäksi C#: ssä käyttämällä Aspose.Medical. Tämä lähestymistapa mahdollistaa tehokkaan joukkotietojen viennin analyysille, tietokannan tuonnille ja tietolähteen integroinnille.

 Suomi