Aspose.Medical DICOM Anonymizer .NET-tietokantaan
Miten yhdistää anonyymejä tiedostoja DICOM tutkimukset

Miten yhdistää anonyymejä tiedostoja DICOM tutkimukset

Tämä opetusohjelma osoittaa, miten yhdistää anonyymejä useita DICOM-tiedostoja kansiosta käyttämällä C#:tä. Kun työskentelet satojen tai tuhansia lääketieteellisiä kuvatietoja, yhdistelmän käsittely on välttämätöntä tehokkuuden ja johdonmukaisuuden kannalta.

Batch Anonymisaation hyödyt

  • Tehokkuus:- Käsittele koko tutkimus tai arkistot yhdessä toiminnassa.

  • Yhdenmukaisuus:- Sovelletaan samoja anonymisaation sääntöjä kaikille tiedostoille.

  • Automaatio:- Integroitu automaattisiin työvirtoihin ja putkeihin.

Edellytykset: Ympäristön valmistelu

  • Aseta Visual Studio tai yhteensopiva .NET IDE.
  • Luo uusi .NET 8 -konsolin sovellusprojekti.
  • Asenna Aspose.Medical NuGet Package Managerista.
  • Valmista sisäänkäyntikortti DICOM-tiedostojen kanssa ja luo lähtökatka.

Vaiheittainen opas DICOM-tiedostojen anonymisointiin

Vaihe 1: Asenna Aspose.Medical

Lisää Aspose.Medical -kirjasto projektillesi NuGetin avulla.

Install-Package Aspose.Medical

Vaihe 2: Sisällytä tarvittavat nimet

Lisää viittauksia vaadittuihin nimipaikkoihin koodissasi.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Vaihe 3: Aseta direktori reitit

Määritä sisäänkäynti- ja lähtötiedoston reitit.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Vaihe 4: Luettele DICOM-tiedostoja

Hanki kaikki DICOM-tiedostot sisäänkirjaimesta, mukaan lukien alihankkijat.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Vaihe 5: Luo Anonymizer

Luo Anonymizer-esimerkki haluamasi profiilisi kanssa.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Vaihe 6: Kunkin tiedoston käsittely

Käy läpi jokaisen tiedoston, anonymisoi sen ja tallentaa sen lähtötiedostoon.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Täydellinen koodi esimerkki Batch Anonymization

Tässä on täydellinen esimerkki, joka osoittaa matkan anonymisaation edistymisraportin kanssa:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Paralleli käsittely parempaan suorituskykyyn

Suuriin tietokoneisiin käytä rinnakkaista käsittelyä useiden CPU-koreiden hyödyntämiseen:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Lisääntynyt versio logging

Tuotantoympäristöissä toteutetaan asianmukainen logging:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Parhaat käytännöt Batch-käsittelyssä

  • Kopioi tietoja: Käsittelee aina alkuperäisten tietojesi kopiota, ei itse alkutuotteita.
  • Log All Operations: Pidä yksityiskohtaisia arkistoja, joiden tiedostoja on käsitelty ja mitä virheitä on tapahtunut.
  • Test First: Käynnistä pienellä näytöllä ennen koko tietokannan käsittelyä.
  • Monitor Disk Space: Varmistaa riittävän levyn tilan lähtötiedostoille.
  • Handle Interruptions: Harkitse tarkastuspisteen/resume-toimintojen toteuttamista hyvin suurille matkoille.

Troubleshooting

Muistikysymykset suurilla tietokoneilla

Erittäin suurille tiedostoille tai tietokoneet käsittelevät tiedostot kerralla ilman viittauksia:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Luvan virheet

Varmista, että sovelluksesi on lukenut pääsyn sisäänkirjaimelle ja kirjoittanut pääsyä tuloskirjaan.

johtopäätöksiä

Tämä opetusohjelma on osoittanut, miten yhdistää anonyymejä DICOM-tiedostoja C#: ssä käyttämällä Aspose.Medical. Riippumatta siitä, käsittelevätko satoja tai tuhansia tietoja, yhdistelmä lähestymistapa varmistaa johdonmukaisen anonymisoinnin koko tietokannan kautta samalla, kun se tarjoaa edistymisen seurannan ja virheiden käsittelyn tuotannon luotettavuuteen.

 Suomi