Cómo anonimizar un folleto de estudios de DICOM

Cómo anonimizar un folleto de estudios de DICOM

Este tutorial demuestra cómo combinar anónimos varios archivos DICOM de una carpeta utilizando C#. Al trabajar con cientos o miles de ficheros de imagen médica, el procesamiento de combinación es esencial para la eficiencia y la coherencia.

Beneficios de la anonimización de Batch

  • Eficiencia:- Procesar los estudios o archivos enteros en una sola operación.

  • Consistencia:- Aplique las mismas reglas de anonimato a todos los archivos.

  • Automación:- Integración en flujos de trabajo automatizados y tuberías.

Requisitos: Preparación del medio ambiente

  • Instalar Visual Studio o cualquier compatible .NET IDE.
  • Crea un nuevo proyecto de aplicación .NET 8 consola.
  • Instalar Aspose.Medical desde el NuGet Package Manager.
  • Prepare la carpeta de entrada con los archivos DICOM y crea una carpa de salida.

Guía paso a paso para anonimizar los archivos de DICOM

Paso 1: Instalar Aspose.Medical

Añade la biblioteca de Aspose.Medical a su proyecto utilizando NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Paso 2: Incluir los espacios de nombre necesarios

Añade las referencias a los espacios de nombre requeridos en su código.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Paso 3: Configurar los pasos de directorios

Define sus caminos de directorio de entrada y salida.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Paso 4: Enumera los archivos DICOM

Obtenga todos los archivos DICOM del directorio de entrada, incluidas las subdirectorías.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Paso 5: Crea el anónimo

Crea un caso de Anonymizador con su perfil deseado.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Paso 6: Procesar cada archivo

Pasar por cada archivo, anonimizarlo y salvarlo en el directorio de salida.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Exemplos de código completo para la anonimización de Batch

Aquí hay un ejemplo completo de demostración de la anonimización del grupo con el informe de progreso:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Procesamiento paralelo para un mejor rendimiento

Para los grandes conjuntos de datos, utilice el procesamiento paralelo para aprovechar varios núcleos CPU:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Versión mejorada con logging

Para los entornos de producción, implementar el logging adecuado:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Las mejores prácticas para el procesamiento de batch

  • Run on Copy of Data: siempre procesamos una copia de sus datos originales, no los mismos.
  • Log Todas las operaciones: Mantiene registros detallados de los archivos que se han procesado y cualquier error encontrado.
  • Test First: Ejecutar una muestra pequeña antes de procesar todo el conjunto de datos.
  • Monitor Disk Space: Asegurar espacio de disco suficiente para los archivos de salida.
  • Handle Interruptions: Considere la implementación de la funcionalidad de punto de verificación/resumen para batallas muy grandes.

Troubleshooting

Problemas de memoria con grandes conjuntos de datos

Para los archivos muy grandes o conjuntos de datos, procesar los ficheros una a la otra sin mantener las referencias:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Errores de permiso

Asegúrese de que su aplicación ha leído el acceso al directorio de entradas y escriba el derecho a la entrada.

Conclusión

Este tutorial ha demostrado cómo anonimizar los archivos DICOM en C# utilizando Aspose.Medical. Ya sea procesando cientos o miles de ficheros, el enfoque de batch garantiza una anónima coherente a través de todo su conjunto de datos mientras proporciona el seguimiento del progreso y el manejo de errores para la fiabilidad de la producción.

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