Cómo anonimizar un folleto de estudios de DICOM
Este tutorial demuestra cómo combinar anónimos varios archivos DICOM de una carpeta utilizando C#. Al trabajar con cientos o miles de ficheros de imagen médica, el procesamiento de combinación es esencial para la eficiencia y la coherencia.
Beneficios de la anonimización de Batch
Eficiencia:- Procesar los estudios o archivos enteros en una sola operación.
Consistencia:- Aplique las mismas reglas de anonimato a todos los archivos.
Automación:- Integración en flujos de trabajo automatizados y tuberías.
Requisitos: Preparación del medio ambiente
- Instalar Visual Studio o cualquier compatible .NET IDE.
- Crea un nuevo proyecto de aplicación .NET 8 consola.
- Instalar Aspose.Medical desde el NuGet Package Manager.
- Prepare la carpeta de entrada con los archivos DICOM y crea una carpa de salida.
Guía paso a paso para anonimizar los archivos de DICOM
Paso 1: Instalar Aspose.Medical
Añade la biblioteca de Aspose.Medical a su proyecto utilizando NuGet.
Install-Package Aspose.MedicalPaso 2: Incluir los espacios de nombre necesarios
Añade las referencias a los espacios de nombre requeridos en su código.
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;Paso 3: Configurar los pasos de directorios
Define sus caminos de directorio de entrada y salida.
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);Paso 4: Enumera los archivos DICOM
Obtenga todos los archivos DICOM del directorio de entrada, incluidas las subdirectorías.
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
inputDirectory,
"*.dcm",
SearchOption.AllDirectories
);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");Paso 5: Crea el anónimo
Crea un caso de Anonymizador con su perfil deseado.
Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
// ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);Paso 6: Procesar cada archivo
Pasar por cada archivo, anonimizarlo y salvarlo en el directorio de salida.
int successCount = 0;
int failCount = 0;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
try
{
// Load DICOM file
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
// Anonymize
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
// Preserve relative directory structure
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
// Ensure subdirectory exists
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
// Save anonymized file
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
}
}
Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");Exemplos de código completo para la anonimización de Batch
Aquí hay un ejemplo completo de demostración de la anonimización del grupo con el informe de progreso:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");
// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();
int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
try
{
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
// Progress reporting
double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
}
}
Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");Procesamiento paralelo para un mejor rendimiento
Para los grandes conjuntos de datos, utilice el procesamiento paralelo para aprovechar varios núcleos CPU:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");
// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();
// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
try
{
// Each thread gets its own anonymizer instance
Anonymizer anonymizer = new();
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
{
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
}
anonymizedDcm.Save(outputPath);
Interlocked.Increment(ref successCount);
}
catch (Exception ex)
{
Interlocked.Increment(ref failCount);
failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
}
});
Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
if (failedFiles.Any())
{
Console.WriteLine($"\nFailed files:");
foreach (string failure in failedFiles)
{
Console.WriteLine($" - {failure}");
}
}Versión mejorada con logging
Para los entornos de producción, implementar el logging adecuado:
using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();
logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");
int successCount = 0;
int failCount = 0;
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
try
{
DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
successCount++;
logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
}
catch (Exception ex)
{
failCount++;
logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
}
}
logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");
// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);
Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");Las mejores prácticas para el procesamiento de batch
- Run on Copy of Data: siempre procesamos una copia de sus datos originales, no los mismos.
- Log Todas las operaciones: Mantiene registros detallados de los archivos que se han procesado y cualquier error encontrado.
- Test First: Ejecutar una muestra pequeña antes de procesar todo el conjunto de datos.
- Monitor Disk Space: Asegurar espacio de disco suficiente para los archivos de salida.
- Handle Interruptions: Considere la implementación de la funcionalidad de punto de verificación/resumen para batallas muy grandes.
Troubleshooting
Problemas de memoria con grandes conjuntos de datos
Para los archivos muy grandes o conjuntos de datos, procesar los ficheros una a la otra sin mantener las referencias:
foreach (string filePath in dicomFiles)
{
using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
{
DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
anonymizedDcm.Save(outputPath);
}
// Files are disposed after each iteration
}Errores de permiso
Asegúrese de que su aplicación ha leído el acceso al directorio de entradas y escriba el derecho a la entrada.
Conclusión
Este tutorial ha demostrado cómo anonimizar los archivos DICOM en C# utilizando Aspose.Medical. Ya sea procesando cientos o miles de ficheros, el enfoque de batch garantiza una anónima coherente a través de todo su conjunto de datos mientras proporciona el seguimiento del progreso y el manejo de errores para la fiabilidad de la producción.