Aspose.Medical DICOM Anonymizer pro znalostní základnu .NET
Jak smazat anonymní složku studií DICOM

Jak smazat anonymní složku studií DICOM

Tento tutoriál ukazuje, jak anonymizovat více souborů DICOM z složky pomocí C#. Když pracujete s stovkami nebo tisíci lékařských obrazových součástí, zpracování sadu je nezbytné pro efektivitu a konzistenci.

Výhody anonymizace batchů

  • innost:- Zpracujte celé studie nebo archivy v jedné operaci.

  • konzistence:- Na všechny soubory použijte stejná pravidla anonymizace.

  • Automatizace:- Integrujte do automatizovaných pracovních toků a potrubí.

Předpoklady: Příprava životního prostředí

  • Nastavení Visual Studio nebo jakéhokoli kompatibilního .NET IDE.
  • Vytvořte nový projekt aplikace .NET 8 konzole.
  • Instalace aplikace Aspose.Medical z programu NuGet Package Manager.
  • Připravte vstupní složku s soubory DICOM a vytvořte výstupní folder.

Krok za krokem průvodce k anonymizaci souborů DICOM

Krok 1: Instalace Aspose.Medical

Přidejte do svého projektu knihovnu Aspose.Medicine pomocí aplikace NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Krok 2: Vložte potřebné názevové prostory

Přidejte odkazy na požadované názevové prostory ve vašem kódu.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

Krok 3: Nastavení adresářů

Definujte své vstupní a výstupní průvodce.

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

Krok 4: Seznam DICOM souborů

Získejte všechny soubory DICOM z vstupního adresáře, včetně podřízenin.

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(
    inputDirectory, 
    "*.dcm", 
    SearchOption.AllDirectories
);

Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.");

Krok 5: Vytvořte anonymizaci

Vytvořte příklad anonymizace s požadovaným profilem.

Anonymizer anonymizer = new();
// Or with a custom profile:
// ConfidentialityProfile profile = ConfidentialityProfile.CreateDefault(
//     ConfidentialityProfileOptions.BasicProfile
// );
// Anonymizer anonymizer = new(profile);

Krok 6: Zpracování každého souboru

Projděte přes každý soubor, anonymizujte ho a uložte do výstupního adresáře.

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        // Load DICOM file
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        
        // Anonymize
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        // Preserve relative directory structure
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        // Ensure subdirectory exists
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        // Save anonymized file
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        Console.WriteLine($"✓ Processed: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {filePath} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\nCompleted: {successCount} succeeded, {failCount} failed.");

Kompletní příklad kódu pro anonymizaci batchů

Zde je kompletní příklad demonstrace anonymizace s výkazem pokroku:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

// Ensure output directory exists
Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

// Get all DICOM files
string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Create anonymizer
Anonymizer anonymizer = new();

int successCount = 0;
int failCount = 0;
int total = dicomFiles.Length;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        successCount++;
        
        // Progress reporting
        double progress = (double)(successCount + failCount) / total * 100;
        Console.WriteLine($"[{progress:F1}%] ✓ {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        Console.WriteLine($"✗ Failed: {Path.GetFileName(filePath)} - {ex.Message}");
    }
}

Console.WriteLine($"\n========================================");
Console.WriteLine($"Batch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");
Console.WriteLine($"========================================");

Paralelní zpracování pro lepší výkon

Pro velké databáze použijte paralelní zpracování pro využití několika CPU jezdců:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;
using System.Collections.Concurrent;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);
Console.WriteLine($"Found {dicomFiles.Length} DICOM files to process.\n");

// Thread-safe counters
int successCount = 0;
int failCount = 0;
ConcurrentBag<string> failedFiles = new();

// Process in parallel
Parallel.ForEach(dicomFiles, new ParallelOptions { MaxDegreeOfParallelism = Environment.ProcessorCount }, filePath =>
{
    try
    {
        // Each thread gets its own anonymizer instance
        Anonymizer anonymizer = new();
        
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        
        lock (outputDirectory) // Ensure directory creation is thread-safe
        {
            Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        }
        
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        Interlocked.Increment(ref successCount);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Interlocked.Increment(ref failCount);
        failedFiles.Add($"{filePath}: {ex.Message}");
    }
});

Console.WriteLine($"\nBatch Anonymization Complete");
Console.WriteLine($"Succeeded: {successCount}");
Console.WriteLine($"Failed: {failCount}");

if (failedFiles.Any())
{
    Console.WriteLine($"\nFailed files:");
    foreach (string failure in failedFiles)
    {
        Console.WriteLine($"  - {failure}");
    }
}

Vylepšená verze s přihlášením

Pro výrobní prostředí, provádět správné logování:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Anonymization;

string inputDirectory = @"C:\DicomStudies\Input";
string outputDirectory = @"C:\DicomStudies\Anonymized";
string logFile = Path.Combine(outputDirectory, "anonymization_log.txt");

Directory.CreateDirectory(outputDirectory);

string[] dicomFiles = Directory.GetFiles(inputDirectory, "*.dcm", SearchOption.AllDirectories);

Anonymizer anonymizer = new();
List<string> logEntries = new();

logEntries.Add($"Anonymization started: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Input directory: {inputDirectory}");
logEntries.Add($"Output directory: {outputDirectory}");
logEntries.Add($"Total files to process: {dicomFiles.Length}");
logEntries.Add("---");

int successCount = 0;
int failCount = 0;

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    string relativePath = Path.GetRelativePath(inputDirectory, filePath);
    
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath);
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        
        string outputPath = Path.Combine(outputDirectory, relativePath);
        Directory.CreateDirectory(Path.GetDirectoryName(outputPath)!);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
        
        successCount++;
        logEntries.Add($"SUCCESS: {relativePath}");
    }
    catch (Exception ex)
    {
        failCount++;
        logEntries.Add($"FAILED: {relativePath} - {ex.Message}");
    }
}

logEntries.Add("---");
logEntries.Add($"Anonymization completed: {DateTime.Now}");
logEntries.Add($"Succeeded: {successCount}");
logEntries.Add($"Failed: {failCount}");

// Write log file
File.WriteAllLines(logFile, logEntries);

Console.WriteLine($"Processing complete. Log saved to: {logFile}");

Nejlepší postupy pro zpracování batchů

  • Run on Copy of Data: Vždy zpracováváte kopii vašich původních údajů, nikoli samotných originálů.
  • Log Všechny operace: Udržujte podrobné záznamy o tom, které soubory byly zpracovány a jakékoli chyby se vyskytly.
  • Test First: Proveďte malý vzorek před zpracováním celého datového souboru.
  • Monitor Disk Space: Zajišťuje dostatečný diskový prostor pro výstupní soubory.
  • Handle Interruptions: Zvažte provádění funkce checkpoint/resume pro velmi velké balíčky.

Troubleshooting

Paměťové problémy s velkými datovými soubory

U velmi velkých souborů nebo datových sítí zpracováváte soubory jednou za čas, aniž byste uchovávali odkazy:

foreach (string filePath in dicomFiles)
{
    using (DicomFile dcm = DicomFile.Open(filePath))
    {
        DicomFile anonymizedDcm = anonymizer.Anonymize(dcm);
        anonymizedDcm.Save(outputPath);
    }
    // Files are disposed after each iteration
}

Chyby povolení

Ujistěte se, že vaše aplikace přečetla přístup do vstupního adresáře a napsala přístup k výstupnímu adresáři.

závěr

Tento tutoriál ukázal, jak batch anonymizovat DICOM soubory v C# pomocí Aspose.Medical. Ať už zpracovává stovky nebo tisíce souborů, setch přístup zajišťuje konzistentní anonymizaci v celé databázi a zároveň poskytuje sledování pokroku a řešení chyb pro spolehlivost výroby.

 Čeština