ASPOSE.MEDICAL DICOM към конвертор за .NET Knowledge Base
Как да конвертирате няколко DICOM файла в един JSON Array

Как да конвертирате няколко DICOM файла в един JSON Array

Този урок показва как да се конвертират няколко DICOM файла в един JSON диапазон с помощта на C#. Този подход е идеален за инженери на данни, които трябва да изнасят метаданни на DIKOM за аналитични инструменти, бази данни или тръби за данни.

Предимства на JSON Array Export

    • Преработване на данни от Булк:- Въвеждане на няколко DICOM записи в бази данни в една операция.

  • Анализът е готов:- JSON радиуси могат да бъдат изтеглени директно в Python, Spark или съхранение на данни.

    • Съвместим изход *:- Един файл, съдържащ всички метаданни, улеснява управлението на данните.

Предимства: Подготвяне на околната среда

  • Visual Studio или всяка съвместима .NET IDE.
  • Създаване на нов проект за .NET 8 конзола.
  • Инсталирайте Aspose.Medical от NuGet Package Manager.
  • Подгответе папка, съдържаща няколко DICOM файла.

Стъпка по стъпка ръководство за конвертиране на множество DICOM файлове в JSON Array

Стъпка 1: Инсталирайте Aspose.Medical

Добавете библиотеката Aspose.Medical към вашия проект с помощта на NuGet.

Install-Package Aspose.Medical

Стъпка 2: Включете необходимите имена

Добавете препратки към необходимите имена в кода си.

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

Стъпка 3: Изтегляне на множество DICOM файлове

Изтеглете DICOM файлове от папка в колекция.

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
}

Стъпка 4: Изтегляне на Dataset Array

Създайте редица обекти на Dataset от изтеглените файлове.

Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

Стъпка 5: Сериализиране на JSON Array

Използване DicomJsonSerializer.Serialize Също така, с базата данни.

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

Стъпка 6: Спасете JSON Array

Съхранявайте JSON array към файл.

File.WriteAllText("dicom_studies.json", jsonArray);
Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} DICOM datasets to JSON array.");

Допълнителен код Пример

Ето пълен пример, който показва как да конвертирате няколко DICOM файла в JSON диапазон:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string outputFile = "dicom_studies.json";

// Get all DICOM files
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
Console.WriteLine($"Found {dicomPaths.Length} DICOM files.");

// Load all files
List<DicomFile> dicomFiles = new();
foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        dicomFiles.Add(DicomFile.Open(path));
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Skipping invalid file: {Path.GetFileName(path)}");
    }
}

// Build dataset array
Dataset[] datasets = dicomFiles
    .Select(dcm => dcm.Dataset)
    .ToArray();

// Serialize to JSON array
string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);

// Save to file
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Successfully exported {datasets.Length} datasets to {outputFile}");

Пример за JSON Array Output

Резултатът от JSON array изглежда така:

[
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "DOE^JOHN" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["12345"] }
  },
  {
    "00080005": { "vr": "CS", "Value": ["ISO_IR 100"] },
    "00100010": { "vr": "PN", "Value": [{ "Alphabetic": "SMITH^JANE" }] },
    "00100020": { "vr": "LO", "Value": ["67890"] }
  }
]

Обработка на големи данни с LINQ

За по-добро управление на паметта с големи набори данни, използвайте LINQ проекции:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\LargeDicomArchive";
string outputFile = "large_export.json";

// Process files lazily to manage memory
Dataset[] datasets = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm")
    .Select(path => 
    {
        try
        {
            return DicomFile.Open(path).Dataset;
        }
        catch
        {
            return null;
        }
    })
    .Where(ds => ds != null)
    .ToArray()!;

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
File.WriteAllText(outputFile, jsonArray);

Console.WriteLine($"Exported {datasets.Length} datasets.");

Добавяне на доклади за напредък

За големи мачове, добавете доклад за напредък:

using Aspose.Medical.Dicom;
using Aspose.Medical.Dicom.Serialization;

string inputFolder = @"C:\DicomStudies";
string[] dicomPaths = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");

List<Dataset> datasets = new();
int processed = 0;
int total = dicomPaths.Length;

foreach (string path in dicomPaths)
{
    try
    {
        DicomFile dcm = DicomFile.Open(path);
        datasets.Add(dcm.Dataset);
    }
    catch (Exception ex)
    {
        Console.WriteLine($"Error: {Path.GetFileName(path)} - {ex.Message}");
    }
    
    processed++;
    if (processed % 100 == 0 || processed == total)
    {
        Console.WriteLine($"Progress: {processed}/{total} ({processed * 100 / total}%)");
    }
}

string jsonArray = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets.ToArray(), writeIndented: true);
File.WriteAllText("export.json", jsonArray);

Console.WriteLine($"Export complete: {datasets.Count} datasets.");

Импортиране на JSON Array в аналитични инструменти

Пример за Python 

import json
import pandas as pd

# Load the exported JSON array
with open('dicom_studies.json', 'r') as f:
    dicom_data = json.load(f)

# Convert to DataFrame for analysis
df = pd.json_normalize(dicom_data)
print(df.head())

Изтегляне в MongoDB 

// Using mongoimport
// mongoimport --db medical --collection studies --jsonArray --file dicom_studies.json

Паметни съображения

Когато работите с много големи набори от данни:

  • Процес в батерии: Разделяне на файловете в пакети от 100-500 файла.
  • Stream Output: Използвайте сериализация, базирана на потока, за много големи радиатори.
  • Създаване на файлове: Уверете се, че обектите на DicomFile се отстраняват след извличане на данни.
// Batch processing example
int batchSize = 100;
string[] allFiles = Directory.GetFiles(inputFolder, "*.dcm");
int batchNumber = 0;

for (int i = 0; i < allFiles.Length; i += batchSize)
{
    string[] batch = allFiles.Skip(i).Take(batchSize).ToArray();
    Dataset[] datasets = batch
        .Select(path => DicomFile.Open(path).Dataset)
        .ToArray();
    
    string batchJson = DicomJsonSerializer.Serialize(datasets, writeIndented: true);
    File.WriteAllText($"batch_{batchNumber++}.json", batchJson);
}

Допълнителна информация

  • Форматът JSON Array е идеален за масови вноски в NoSQL бази данни.
  • Помислете за компресиране на големи JSON файлове за ефективност на съхранението.
  • За стрийминг сценарии, помислете за използването на NDJSON (newline-delimited JSON) формат вместо.

заключение

Този урок ви е показал как да конвертирате няколко DICOM файла в един JSON диапазон в C# с помощта на Aspose.Medical. Този подход позволява ефективен износ на масивни данни за анализи, вноски на бази данни и интеграция на тръбопровода.

 Български